bowtie: リードをマッピングするツール。 http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml現時点(2012/05/07)で最新版は0.12.7。 http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie/ 0.12.8ってディレクトリは空。よくわからない。Linuxのサーバに入…

研究室のクラスタマシンはblastで、自宅のMBPにはblast+が入っててメンドイ。blast+の方が高性能っぽいしクラスタの方にも入れたい。 とりあえず自分が使うときのblast+の方のblastnのコマンドメモ。 blastn -query query.fasta -db yeast.nt -out result.ou…