aaikmyz's diary

聴いた音楽とか見た映画とか行った美術館とかを記録しておきたい。

2012-01-01から1年間の記事一覧

TopHat, Cufflinks, cummeRbund

RNA-seqデータの解析のための準備。流れとしては NGSから得られたfastqファイルをTophatでマッピング ↓ Cufflinksに付属するcuffdiffで複数サンプルのマッピング結果の発現量の定量と発現量の差を解析 ↓ RのcummeRbundを使って解析結果を可視化 という感じ。…

有線接続しているWin7機を無線LANアクセスポイントにする

Windowsでもできたんだね。 まずはここを参考に http://www.atmarkit.co.jp/fwin2k/win7/12wlan/12wlan_02.html管理者権限で起動したコマンドプロンプトで netsh wlan show hostednetwork して状況を確認。「ホストされたネットワークの状態」は「未開始」に…

ダークナイト・ライジング(原題:The Dark Knight Rises)見た(ネタバレあり)

面白かったけど長すぎでしょ。いや無駄なシーンそんななかったと思うから必要なんだと思うけどケツが痛くなった。 以下箇条書きで感想・ラストは実は自動操縦にセットしてあってバットマンは脱出済み→「クリーン・スレート」でブルースとセリーナの個人情報…

perlで図形描画

perlで図形を描画するにはGDというモジュールを使う。 cpanm GDこれだけでできればよかったんだけど、libgdというライブラリがないとかなんとかでエラーが出た。 調べたらgd-develを入れればよさそう( http://nloggg.blogspot.jp/2010/02/perl.html )。 rpm…

Vimを終了した後もundoできるようにする

Vim

.vimrcに set undodir=~/.vimundo :set undofileと記述しておくことで、Vimを一旦終了した後もuでundoできるようになる。 undoのためのファイルはこの設定だと~/.vimundo/に保存される。 勝手に消えたりしないので、たまに掃除しないと容量が大変になるかも…

bowtie

bowtie: リードをマッピングするツール。 http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml現時点(2012/05/07)で最新版は0.12.7。 http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie/ 0.12.8ってディレクトリは空。よくわからない。Linuxのサーバに入…

シェルでファイル名の一括置換とか

hoge01.txt hoge02.txt ...みたいなのを hoge01_foo.txt hoge02_foo.txt ...にしたいときは for F in hoge*\.txt; do mv $F ${F/\.txt/_foo\.txt}; done とかすればよい。

Vimで複数行に同じ文字列を挿入する

abcxyz abcxyz abcxyzって文字列の各行の真ん中に"123"を入れて"abc123xyz"にしたい、みたいなときは 1番上のxにカーソル合わせてCtrl+v→2jでxを3つ選択 ↓ I(大文字のi)で挿入モードに入り、123を入力 ↓ escで挿入モード抜けるでできる。

iTunes Libraryファイルをいじったらライブラリからムービーを選ぼうとするとiTunesが即落ちるようになったけど解決した

Macで作ったiTunes LibraryファイルをBootcampのWindowsでも読めるようにしようと思ってなんか拡張子つけたりした ↓ 拡張子つけたファイルはMacでは別物扱いされたので新しくiTunes Libraryファイルが生成される ↓ 知らずにムービー追加したりした ↓ iTunes…

Windows 7 x64 で化石のようなスキャナ EPSON GT-7600U を使う

ここ( http://w7.vector.jp/softrev/detail.php?s_no=73329 )に書いてある通りのことをすればいいんだけど,一度ドライバをインストールしたはずなのに,今日つないでみたら使えなかったので再びドライバをインストールする羽目になった。 今後いちいちググ…