2012-12-14から1日間の記事一覧
RNA-seqデータの解析のための準備。流れとしては NGSから得られたfastqファイルをTophatでマッピング ↓ Cufflinksに付属するcuffdiffで複数サンプルのマッピング結果の発現量の定量と発現量の差を解析 ↓ RのcummeRbundを使って解析結果を可視化 という感じ。…
RNA-seqデータの解析のための準備。流れとしては NGSから得られたfastqファイルをTophatでマッピング ↓ Cufflinksに付属するcuffdiffで複数サンプルのマッピング結果の発現量の定量と発現量の差を解析 ↓ RのcummeRbundを使って解析結果を可視化 という感じ。…