2013-01-18から1日間の記事一覧
tophatによって生成されたbamファイルに対してsamtoolsのflagstatを使えばいろんな情報が出てくる。 $ samtools flagstat accepted_hit.bam出力は以下のようになる。 4423480 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) 0 + 0 duplicates 4423480 + …
tophatによって生成されたbamファイルに対してsamtoolsのflagstatを使えばいろんな情報が出てくる。 $ samtools flagstat accepted_hit.bam出力は以下のようになる。 4423480 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) 0 + 0 duplicates 4423480 + …